脚指甲真菌感染也就是甲癣，治疗方法有多种，一般可以通过外用药物、口服药物以及其他治疗方式来处理。通常外用抗真菌药物治疗的话，可能需要连续使用数周甚至数月。
外用药物选择
局部涂抹制剂：像阿莫罗芬搽剂就比较常用，它能渗透进甲板发挥抗真菌作用。使用时要先将病甲清洁干净，然后按照说明书涂抹。不过要注意，涂抹范围最好超出病甲周围正常皮肤一点，这样能更好地抑制真菌扩散。环吡酮胺乳膏：也可用于甲癣治疗，每天涂抹1 - 2次，坚持使用能抑制真菌生长，但要坚持用药，一般需要持续数周。
口服药物治疗
伊曲康唑：它是一种常用的口服抗真菌药，采用冲击疗法，即服用1周，停药3周为一个疗程，一般需要2 - 3个疗程。不过在用药前需要检查肝功能，因为它可能会对肝功能有一定影响。特比萘芬：也是口服抗真菌药物，一般每天服用一次，连续服用数周，具体疗程要根据病甲生长情况来定，通常手指甲癣需要服用6 - 12周，脚趾甲癣可能需要12 - 16周。不过服用前也需要关注自身肝功能等情况。
其他治疗方式
手术拔甲：如果病甲情况比较严重，单个指甲患病且其他治疗效果不佳时，可以考虑手术拔甲。但手术拔甲创伤相对较大，术后要注意预防感染，而且新长出来的指甲也有可能再次被真菌感染，术后需要配合抗真菌药物治疗。激光治疗：利用特定波长的激光来破坏真菌，不过激光治疗甲癣目前还处于临床探索阶段，一般需要多次治疗，而且费用相对较高，效果也因人而异。
日常注意事项
保持脚部清洁干燥：每天要清洗双脚，洗完后及时擦干，尤其是脚趾缝之间。穿透气性好的鞋子和袜子，比如棉质袜子，能减少脚部真菌滋生的环境。避免交叉感染：不要与他人共用拖鞋、脚盆等物品，在公共浴室、游泳池等场所要注意防护，防止被他人感染真菌，同时自己患病后也避免传染给他人。定期修剪病甲：定期适当修剪病甲，但要注意不要剪得过于短，避免损伤甲周组织，修剪工具要单独使用并定期消毒。