喉咙两边出现两坨肉肿起的情况，可能是由扁桃体炎、淋巴结炎、慢性咽炎、甲状腺囊肿等疾病导致。以下是具体内容：
一、扁桃体炎：这一病症常伴有扁桃体肿大表现，由于扁桃体处于口咽咽喉两侧，所以喉咙两边有两坨肉肿起很可能是扁桃体炎引发。一般会采用抗生素来治疗，比如头孢类抗生素（如头孢氨苄、头孢呋辛等）、氨基糖苷类（如庆大霉素等）、四环素、氨苄西林钠等。
二、淋巴结炎：当咽喉部的淋巴结遭细菌感染而出现炎症时，容易有喉咙外部两侧肿大现象。通常运用抗生素如头孢氨苄、青霉素钠、罗红霉素等，同时配合抗病毒类药物如更昔洛韦、单磷酸阿糖腺苷等进行治疗。
三、慢性咽炎：可能会对周围器官产生影响或波及，进而引发扁桃体炎，致使出现喉咙两边有两坨肉肿起的状况。一般可使用复方硼砂溶液、呋喃西林溶液、复方氯己定含漱液等药物进行治疗，或者口服碘喉片、薄荷喉片等药物。
四、甲状腺囊肿：它是临床上常见的甲状腺囊性结节，患者的颈部或喉部会有无痛性肿块出现，从而呈现喉咙两边有两坨肉肿起的情形。对此，一般需要通过定期随访或手术对甲状腺进行穿刺引流，同时配合使用甲状腺素类药物来治疗。
需要强调的是，上述所提及的药物必须在医生指导下使用，以避免因用药不当而使病情加重。