尿痛尿不尽可能是由多种原因引起的。比如泌尿系统感染较为常见，像急性膀胱炎，女性发病率相对较高，约占泌尿系统感染的60%左右。
泌尿系统感染导致
膀胱炎：除了尿痛尿不尽，还可能伴有尿频，尿液外观可能混浊，有时会出现血尿。一般是细菌由尿道上行感染引起，比如女性尿道短而直，更易受到细菌侵袭。尿道炎：分为淋菌性尿道炎和非淋菌性尿道炎。淋菌性尿道炎多由淋病奈瑟菌感染所致，主要通过性接触传播；非淋菌性尿道炎常见病原体是沙眼衣原体、生殖支原体等，也可通过性接触传播，患者会有尿道刺痒、尿痛、尿道分泌物等表现。
泌尿系统结石引发
膀胱结石：除了尿痛尿不尽，还可能有排尿中断现象，改变体位后又能继续排尿。结石会刺激膀胱黏膜，导致尿频、尿急等症状，多与营养不良、下尿路梗阻等因素有关。尿道结石：主要症状是排尿困难、点滴状排尿，伴尿痛，严重时可发生急性尿潴留。结石多来自肾和膀胱，停留于尿道狭窄部位。
前列腺相关疾病所致
前列腺炎：分为急性细菌性前列腺炎和慢性前列腺炎。急性细菌性前列腺炎起病急，会有寒战、高热，伴有尿频、尿急、尿痛、排尿不尽感等；慢性前列腺炎症状多样，有骨盆区域疼痛，排尿异常如尿频、尿急、尿痛、尿不尽等，还可能伴有性功能障碍等。多见于中青年男性，久坐、酗酒、长期憋尿等是常见诱因。