三个月宝宝吐奶主要原因包括消化系统不完善、喂养不当以及消化疾病。具体如下：
一、消化系统不完善：
1.三个月宝宝的消化系统尚未发育成熟，消化能力较弱，若喂养量过多，会导致宝宝胃部压力过大而出现吐奶现象。
2.此时宝宝的胃呈水平位，喂奶后让宝宝平躺也容易引发吐奶。宝妈在喂养婴儿时，需注意把控好喂养量，可采取少量多次的喂养方式，喂奶后要竖抱宝宝，让其趴在肩膀上进行拍嗝，不可紧接着让其平躺。不过，随着宝宝三个月后身体的不断发育，各系统会逐渐完善，吐奶症状也会逐渐减轻。
二、喂养不当：
如果宝宝喝奶时没有将乳头全部含在嘴里，就容易在吸奶过程中吸入空气，进而发生吐奶。所以在喂养时要确保孩子将乳头全部含进嘴里。
三、消化疾病：
宝宝抵抗力较弱，容易患上一些胃肠道疾病，比如急性胃肠炎等，这会使宝宝吐奶，同时一般还会伴有精神差、哭闹等表现，此时应及时就医，以免耽误病情。
总结：三个月宝宝吐奶主要由上述三方面原因引起，家长应针对不同情况采取相应措施，当出现因消化疾病导致的吐奶且伴有其他异常表现时，要尽快就医。