左右腋窝温度一般来说没有明显的哪个更准，正常情况下两侧腋窝温度相差通常在0.2℃以内。
测量方法影响
测量前准备：测量腋窝温度前要先擦干腋窝汗液，因为汗液会影响温度测量的准确性。比如如果腋窝有较多汗液，可能会使测得的温度偏低。测量时间要求：测量时要将体温计夹紧，一般需要测量5 - 10分钟。如果测量时间不足，可能会导致温度测量不准确，不管是左侧还是右侧腋窝，都需要保证足够的测量时间。
个体差异情况
正常人群：对于大多数健康人而言，左右腋窝温度差异很小，基本能反映真实体温情况。但如果是身体有特殊状况的人，比如一侧腋窝有炎症等情况时，可能会对温度有一定影响。不过正常情况下这种影响也不会导致左右腋窝温度差异很大而影响判断。特殊人群：比如儿童，由于儿童的体温调节功能还不完善，但左右腋窝温度的差异判断标准和成人一样，都是以正常范围（36℃ - 37℃）为参考，只要在这个范围内，左右腋窝温度都可以用来评估体温状况。
体温波动因素
运动等因素：人在运动后，体温可能会有轻度升高，这时候测量左右腋窝温度都可能会有变化，但一般左右两侧的变化幅度相近。比如人剧烈运动后，两侧腋窝温度可能都会升高0.3℃ - 0.5℃左右，所以从整体体温变化趋势来看，左右腋窝温度都能反映体温的波动情况。饮食等因素：进食后，体温也可能会有少许升高，无论是测量左侧还是右侧腋窝温度，都能观察到这种体温的轻度升高现象，左右腋窝温度的变化趋势是一致的，所以都可以用来判断体温是否在正常波动范围内。