黄体酮是一种天然孕激素，在使用过程中可能会有一些副作用。一般来说，部分人使用黄体酮可能出现头痛、头晕等情况，大约有5% - 10%的人可能会有此类反应。
胃肠道方面的副作用
恶心呕吐： 有的女性在使用黄体酮后会出现恶心的症状，严重的可能会伴随呕吐。大约有3% - 8%的人会出现不同程度的胃肠道不适，表现为食欲下降，进食后有饱腹感，进而影响正常的饮食摄入。腹胀： 使用黄体酮后，部分人会感觉腹部胀满，就像肚子里有气体积聚一样，这种腹胀感可能会持续一段时间，影响日常的活动和舒适度。
神经系统方面的副作用
头晕： 大约有2% - 5%的人在使用黄体酮后会出现头晕的情况，尤其是在用药初期，可能会在站立或行走时感觉头部发昏，需要坐下或躺下休息才能缓解。嗜睡： 有些女性使用黄体酮后会比平时更爱睡觉，睡眠时间可能会延长，白天也容易犯困，影响正常的工作和学习状态。
乳腺方面的副作用
乳房胀痛： 约有10%左右的女性在使用黄体酮后会出现乳房胀痛的现象，触摸乳房时能感觉到比平时更敏感，疼痛程度因人而异，有的可能只是轻微胀痛，有的则较为明显。乳腺增大： 少数人使用黄体酮后会发现乳房有增大的情况，这是因为黄体酮对乳腺组织有一定的刺激作用，导致乳腺腺体组织有所增生。
其他方面的副作用
体重变化： 个别人使用黄体酮后可能会出现体重改变，有的会稍有增加，这可能与体内水钠潴留有关，大约有1% - 3%的人会出现这种情况；也有极少数人可能会出现体重减轻，但相对较少见。皮肤问题： 少数人使用黄体酮后可能会出现皮肤瘙痒的症状，皮肤表面可能没有明显的皮疹，但就是感觉瘙痒难耐，影响皮肤的舒适度。