包皮上长小疙瘩通常需考虑以下几种疾病，要明确病因后对症用药：
一、皮脂腺囊肿：其会突出于皮肤表面，有红、肿、热、痛等炎性表现。一般建议及时就医，确诊后通过手术切除来治疗。
二、毛囊炎：主要呈现出以毛囊为中心的丘疹或脓丘疱疹，有时会有脓疱破裂、结痂情况，还可能伴有疼痛和瘙痒。可在医生指导下服用盐酸米诺环素胶囊、阿奇霉素等药物进行医治。
三、生殖器疱疹：主要表现为皮肤的红斑丘疹、斑丘疹、水疱，常伴有瘙痒或疼痛感。出现症状的患者应及时到医院就诊，在医生指导下服用抗病毒药，同时联合一些外用药物治疗，常用的药物如干扰素凝胶、红霉素软膏等。
四、尖锐湿疣：症状为外阴出现较小的乳头状赘生物，可能伴有疼痛、发痒、性交不适、出血等症状。可在医生指导下使用氟尿嘧啶软膏、鬼臼毒素酊等药物进行处理。
五、珍珠状阴茎丘疹：在阴茎冠状边缘和冠状沟处会出现珍珠状丘疹，通常不痛不痒，只需定期观察就行。
总之，当发现包皮上有小疙瘩时，要及时就医，准确诊断具体是哪种疾病，以便采取合适的治疗措施。