怀孕3个月时出现右侧小腹隐痛，主要考虑存在生理性原因，如子宫增大、子宫右旋等，同时也不能排除病理性原因，像先兆流产、宫外孕、阑尾炎等。
一、生理性原因：
1.子宫增大：孕妇怀孕3个月，子宫会逐渐增大，在这一过程中会牵拉肌肉、韧带，从而引发疼痛。这属于孕期正常生理现象，通常无需治疗。此时孕妇应注意避免劳累，多卧床休息，一般疼痛可得到缓解。
2.子宫右旋：怀孕后多数孕妇会出现子宫右旋，较为敏感的孕妇可能会感觉到小腹隐痛。这也是较为正常的情况，无需特殊处理，只需继续观察即可。
二、病理性原因：
1.先兆流产：在孕早期，若胎儿有先兆流产情况，孕妇会出现小腹隐痛，通常还伴有阴道少量出血，颜色常为暗红色或血性白带，可表现为腹部持续隐痛，并可能伴有腰背部疼痛。建议孕妇适当休息，避免同房，若症状未改善则要及时就医明确病因后进行治疗。一般黄体功能不全者，可遵医嘱通过肌注黄体酮注射液或口服黄体酮软胶囊进行治疗。若阴道流血停止后超声检查显示胎儿可存活，可继续妊娠，若检查提示胎儿发育不良，可在医生指导下终止妊娠。
2.宫外孕：孕妇发生宫外孕时多数为一侧腹痛，若孕囊在右侧输卵管，会导致右侧小腹疼痛，同时还会有不规则阴道出血等情况。临床上对于宫外孕的治疗主要有手术治疗与药物治疗，可根据孕妇身体状况及有无生育要求，遵医嘱选择保守手术或者根治手术。保守手术主要适用于有生育要求且对侧输卵管已切除或病变的孕妇，根治手术适用于无生育要求或处于休克状态的孕妇，此外，病情稳定的孕妇在医生指导下可使用甲氨蝶呤片、复方氟尿嘧啶口服溶液进行治疗。
3.阑尾炎：可能由于各种原因导致阑尾管腔堵塞，或继发细菌感染而引发炎症，从而出现右下腹疼痛。怀孕3个月属于特殊时期，多以保守治疗为主，可在医生指导下应用左氧氟沙星胶囊、青霉素V钾颗粒等药物进行治疗，必要时可行手术切除。
此外，还可能存在其他情况，如妇科合并症如卵巢肿瘤等疾病，需及时就医，避免自行用药，以免因错误处理而延误治疗。
总之，怀孕3个月出现右侧小腹隐痛要综合考虑各种可能的原因，以便采取正确的应对措施。