严重口腔溃疡可以通过局部用药、全身用药等方式来治疗。一般来说，局部用药常用药物有西瓜霜喷剂等，可在发病后尽快使用，能一定程度缓解疼痛、促进愈合。
局部用药选择
含漱剂： 常用的有氯己定含漱液，它能杀灭口腔内的细菌，抑制炎症。使用时取适量含漱，每次含漱1分钟左右，每天可使用2 - 3次。还有康复新液，它可以促进口腔溃疡创面的愈合，用它含漱后能为创面创造良好的修复环境。散剂： 冰硼散也是常用的散剂，将其涂抹在溃疡面上，有清热解毒、消肿止痛的作用。不过涂抹时要注意避免吞咽过多。
全身用药考量
免疫调节剂： 对于自身免疫因素引起的严重口腔溃疡，可能会用到转移因子。它可以调节机体免疫功能，但儿童使用时要谨慎，需在医生指导下根据体重等情况使用。还有胸腺肽，它能增强细胞免疫功能，不过使用前需要进行皮试等相关检查，排除过敏等情况才能使用。维生素类： 补充维生素B族对口腔溃疡也有一定帮助，比如维生素B2。日常生活中可以多从食物中摄取，像谷类、豆类、绿叶蔬菜等富含维生素B族，但如果口腔溃疡严重，也可以在医生指导下额外补充维生素B2片剂。
日常护理要点
饮食调整： 要避免食用辛辣、刺激性食物，如辣椒、花椒等，这些食物会刺激溃疡创面，加重疼痛。也要少吃过烫的食物，过烫的食物会烫伤口腔黏膜，不利于溃疡愈合。可以多吃富含维生素C的水果，如橙子、猕猴桃等，维生素C有助于促进伤口愈合。生活习惯： 保证充足的睡眠，一般成年人每天需要7 - 8小时的睡眠时间，睡眠不足会影响身体的恢复能力，不利于口腔溃疡的愈合。还要保持口腔清洁，每天早晚认真刷牙，饭后可以用清水或淡盐水漱口，清除口腔内的食物残渣，减少细菌滋生，为口腔溃疡的恢复创造良好的口腔环境。