病毒肠胃炎发烧时，可使用以下药物进行治疗：
1.退烧药：如果发烧超过38.5°C，可使用退烧药，如对乙酰氨基酚或布洛芬，以缓解发热症状。
2.止呕药：若恶心、呕吐症状明显，可使用止呕药，如甲氧氯普胺或氯丙嗪，来减轻不适感。
3.调节肠道菌群药物：可使用双歧杆菌三联活菌散、枯草杆菌二联活菌颗粒等药物，帮助调节肠道菌群，缓解腹泻症状。
4.抗病毒药物：对于病毒感染引起的肠胃炎，抗病毒药物可能有一定的疗效，但需在医生的指导下使用，如利巴韦林。
5.补液盐：腹泻可能导致身体脱水，补充口服补液盐有助于维持身体的水分和电解质平衡。
需要注意的是，在使用药物治疗的同时，还应注意以下几点：
1.保持充足的水分摄入，以防脱水。
2.饮食应清淡易消化，避免食用油腻、刺激性食物。
3.注意个人卫生，勤洗手，避免交叉感染。
4.如症状持续不缓解或加重，应及时就医，以便调整治疗方案。
此外，不同人群在使用药物时可能存在差异，如孕妇、哺乳期妇女、儿童、老年人等，应在医生的指导下使用药物。同时，对药物过敏者禁用，过敏体质者慎用。