亚急性甲状腺炎常见症状有甲状腺部位疼痛，一般疼痛可从一侧甲状腺开始，然后向其他部位放射，疼痛程度不一，有的患者疼痛较为剧烈，可持续1~2周甚至更久。通常在发病前1~3周有上呼吸道感染病史，约50%的患者会出现甲状腺功能异常的相关表现，比如发病初期可能出现甲亢症状，像心慌、多汗、手抖等，这是因为甲状腺被炎症破坏后，甲状腺激素释放进入血液导致的，一般持续1~3个月；之后可能会出现甲减症状，如乏力、怕冷、水肿等，不过多数是暂时性的，持续时间可能数周或数月。
甲状腺局部症状表现
疼痛特点： 疼痛可累及耳部，部分患者吞咽时疼痛会加重。甲状腺部位可触及结节，结节质地较硬，有压痛。比如有的患者转头或吞咽时能明显感觉到甲状腺部位的不适。肿大情况： 甲状腺可能会不同程度地肿大，单侧或双侧均可肿大，肿大的甲状腺外形可不规则。
全身症状表现
发热情况： 多数患者会有发热症状，体温一般在38℃左右，也有部分患者体温可达到39℃以上，发热可持续数天至2~3周。例如有些患者发病时会感觉浑身发热，测体温发现升高。全身不适： 患者还可能出现全身乏力、肌肉疼痛等不适，影响日常活动，比如爬楼梯时会明显感觉体力不支。
甲状腺功能相关症状
甲亢表现： 除了心慌、多汗外，还可能出现体重下降，即使食欲正常，但因为代谢加快，体重会逐渐减轻。有的患者情绪也会变得容易激动。甲减表现： 除了乏力、怕冷，还可能出现记忆力减退，对周围事物反应变得迟缓。大便也会变得干燥，排便次数减少。
病程发展相关症状
病程阶段性： 亚急性甲状腺炎病程一般分为甲亢期、甲减期和恢复期。在甲亢期过后进入甲减期时，上述甲减症状会明显，而随着病情进入恢复期，甲状腺功能逐渐恢复正常，相关症状也会慢慢减轻直至消失。比如经过积极调整，患者怕冷、乏力等症状会逐渐缓解，甲状腺疼痛等局部症状也会改善。