卵巢早衰指女性40岁前出现卵巢功能减退，发病率在一般人群中约为1%~3%。其发病原因主要有以下几方面：
遗传因素：
染色体异常： 约10%~20%的卵巢早衰与染色体异常有关，如X染色体异常，常见的有特纳综合征（45，XO）及其变异型，这些染色体异常会直接影响卵巢的正常发育和功能，导致卵巢早衰提前发生。基因突变： 某些特定基因的突变也可能引发卵巢早衰。例如FOXL2基因的突变，会干扰卵泡的正常生长和发育过程，使得卵巢功能逐渐衰退。
自身免疫因素：
免疫系统攻击卵巢： 自身免疫性疾病是导致卵巢早衰的重要原因之一。当身体的免疫系统错误地将卵巢组织当作外来异物进行攻击时，就会破坏卵巢的正常结构和功能。像甲状腺炎、肾上腺皮质功能减退等自身免疫性疾病，常常会伴随卵巢早衰的发生。据统计，约有10%~20%的卵巢早衰患者合并有自身免疫性疾病。自身抗体产生： 患者体内会产生针对卵巢组织的自身抗体，这些抗体可以损伤卵巢的卵泡细胞，影响卵泡的生成和发育，进而导致雌激素分泌减少，卵巢功能衰退。
医源性因素：
手术影响： 盆腔手术可能会损伤卵巢的血液供应或破坏卵巢组织，从而引发卵巢早衰。例如卵巢囊肿剥除术、子宫切除术等，如果手术操作不当，波及卵巢，就有可能导致卵巢功能受损。一般来说，盆腔手术后发生卵巢早衰的风险会根据手术范围和操作的不同而有所差异，有的可能在5%左右。放疗和化疗： 接受盆腔部位的放疗或某些化疗药物治疗，也可能导致卵巢早衰。放疗会直接破坏卵巢内的卵泡细胞，化疗药物则可能通过影响卵泡的增殖和分化过程，引起卵巢功能衰退。通常在化疗后，患者的卵巢功能恢复的可能性较小，尤其是大剂量化疗或长期放疗后，卵巢早衰的发生风险明显增加。