尿尿时阴茎疼可能是由多种因素导致的，包括局部损伤、尿道炎、前列腺炎、包皮龟头炎、尿道结石等，同时可能还伴有尿频、尿急等症状，应及时就医并遵医嘱进行针对性治疗。
一、局部损伤：
1.过度挤压、外力撞击等因素可能致使尿道或尿道口部位受损。
2.在排尿过程中，受损部位受到尿液刺激，从而引发尿尿阴茎疼。
3.治疗上可使用止痛类药物如双氯芬酸钠肠溶片、布洛芬片等，以及抗感染药物如头孢地尼分散片等。
二、尿道炎：
1.比如细菌性尿道炎或淋菌性尿道炎，会导致尿道局部受损。
2.出现尿尿阴茎疼，且伴有尿频、尿急等症状。
3.可应用敏感抗生素类药物进行治疗，如西他沙星片、头孢克洛片、左氧氟沙星片等。
三、前列腺炎：
1.可能与频繁手淫、不洁性生活等因素相关，引发感染。
2.因局部炎症持续破坏刺激前列腺，造成局部损伤及充血，进而导致尿尿阴茎疼，还可能伴有尿不尽、尿频、会阴部胀痛等症状。
3.可使用西他沙星、盐酸坦索罗辛缓释胶囊等药物治疗，同时配合微波理疗、热疗等物理疗法。
四、包皮龟头炎：
1.可由感染、包皮过长、局部刺激等因素诱发。
2.男性存在包皮龟头炎时，可能会波及尿道口部位，使尿道口部位受损，容易引起尿尿阴茎疼，还可能伴有瘙痒等症状。
3.治疗上可使用高锰酸钾进行湿敷，若是细菌性包皮龟头炎，可使用莫匹罗星软膏、氧氟沙星等；若是滴虫性包皮龟头炎，可使用甲硝唑、替硝唑；若是念珠菌性包皮龟头炎，可使用曲安奈德益康唑乳膏、伊曲康唑等药物。
五、尿道结石：
1.通常继发于膀胱结石。
2.在排尿时，由于尿道受到结石的刺激，可引起尿尿阴茎疼，疼痛往往较为剧烈，同时伴有排尿困难等症状。
3.确诊后应进行相应的排石处理，如尿道激光碎石术、尿道结石取石术等。
总之，当出现尿尿阴茎疼时，要及时就医明确病因，并根据具体情况进行针对性的治疗，以缓解症状，避免病情进一步加重。