发烧肌肉出现酸痛的原因需结合发烧诱因来看，主要有外伤、感染和中暑。
一、外伤：
包括手术创伤、跌打损伤等。这类患者在发烧过程中，由于创伤会释放出过多的乳酸和肌酸激酶，这些酸性物质会在体内，尤其是横纹肌和骨骼肌中持续积累。如果不能及时排出体外，就可能因此导致肌肉疼痛。不过，这种情况通常在外伤康复后会自行缓解。
二、感染：
比如细菌感染、病毒感染以及微生物感染等。当这些致病菌进入人体后，会引发炎性反应，在发烧时可能会释放出毒素，如白介素、前列腺素、前列素环、白三烯、炎性介质等，并且会在体内释放和游走，容易导致神经根明显刺痛，进而引起周身肌肉酸痛。
三、中暑：
人在中暑时可能会产生热惊厥，严重时会发生热衰竭，此时身体体温会明显增高，从而导致身体抽搐，而抽搐结束后肌肉可能会有酸痛感，但这种情况会随着时间慢慢好转。
总之，发烧伴肌肉酸痛可能由多种原因引起，需要根据具体情况进行分析和诊断，以便采取合适的治疗措施。