女性卵巢发育不良可能由多种原因引起，且会带来多方面危害。一般来说，遗传因素是常见原因之一，约有10%-15%的卵巢发育不良与染色体异常有关，比如特纳综合征，就是由于性染色体异常导致卵巢发育异常。另外，自身免疫性疾病也可能引发卵巢发育不良，像甲状腺炎等自身免疫性疾病，会错误地攻击卵巢组织，影响卵巢正常功能。还有医源性因素，比如接受过盆腔放疗、化疗等治疗，可能损伤卵巢细胞，导致卵巢发育不良。
遗传因素相关情况
染色体异常导致： 像特纳综合征，是因为性染色体数目或结构异常，约55%的特纳综合征患者是45，XO核型，这种情况下卵巢无法正常发育，出生时就可能表现出一些特征，如身材矮小等。家族遗传倾向： 如果家族中有卵巢发育不良的遗传病史，后代患病风险会相对增加，不过具体遗传方式还需进一步医学检测确定。
自身免疫性疾病影响
甲状腺炎关联： 当患有自身免疫性甲状腺炎时，身体的免疫系统会把甲状腺组织当作攻击目标，同时可能波及卵巢组织，使卵巢的正常结构和功能受到破坏，进而影响卵子的生成和卵巢激素的分泌。其他自身免疫病： 如系统性红斑狼疮等自身免疫病，也可能间接影响卵巢，导致卵巢发育不良情况出现，只是相对甲状腺炎关联程度可能稍低。
医源性因素影响
盆腔放疗影响： 女性如果因某些盆腔部位的恶性肿瘤接受放疗，射线可能会损伤卵巢内的生殖细胞和间质细胞，一般放疗剂量越高，对卵巢的损伤风险越大，而且放疗后卵巢功能恢复的可能性也会降低。化疗药物影响： 一些化疗药物，如环磷酰胺等，在杀伤肿瘤细胞的同时，也可能对卵巢细胞造成毒性作用，导致卵巢卵泡耗竭，引起卵巢发育不良，化疗疗程越多，对卵巢的损害往往越明显。卵巢发育不良的危害主要有月经异常，多数患者会出现月经稀发、闭经等情况，影响正常的生理周期。还会导致生育能力下降，因为卵巢发育不良会影响卵子的产生和排出，使得受孕几率大大降低，甚至可能导致不孕。另外，还会引起雌激素缺乏相关表现，比如出现潮热、盗汗、阴道干涩等症状，长期雌激素缺乏还可能增加骨质疏松、心血管疾病等的发生风险。