通常来说不存在绝对“最好”的医院，在杭州看男科相对较好的医院包括杭州市第一人民医院、浙江省立同德医院、浙江大学医学院附属第一医院。
一、杭州市第一人民医院：其建立于五十年代初期，历经近70年的沉淀与发展，已打造出具备一流专业素养的团队以及先进医疗设施的临床专科。现今泌尿外科设有53张床位，有临床医师17人，其中主任医师5人，副主任医师5人，博士7人，硕士5人。能够以高水准的医疗水平完成专科范围内所有规范的手术和治疗，且能取得令人满意的临床效果，始终处在国内同类专科的先进之列。
二、浙江省立同德医院：浙江省立同德医院的生殖科擅长运用中西医结合的方式诊治前列腺疾病、泌尿系结石、泌尿系肿瘤、慢性肾功能不全、性功能障碍以及男性不育等泌尿系统疾病，已发展成为以中西医结合治疗泌尿男性生殖系统疾病和开展微创泌尿外科手术为特色的临床专科。
三、浙江大学医学院附属第一医院：浙江大学医学院附属第一医院的泌尿外科，是全国规模较大的泌尿外科中心之一，拥有5个病区共172张床位，属于国家临床重点专科。其在泌尿外科疑难杂病的诊治方面在国内独具特色，经过数十年的发展，在以下方面积累了丰富经验并实现创新发展。
患者在实际生活中可依据自身具体情况来选择适宜的医院就诊。
总结：杭州有多家看男科不错的医院，如杭州市第一人民医院在团队和设施方面表现出色，能高质量完成手术治疗；浙江省立同德医院生殖科在中西医结合诊治泌尿系统疾病方面有特色；浙江大学医学院附属第一医院的泌尿外科则是全国知名，在疑难杂病诊治等方面经验丰富。患者可按需选择。