小孩后脑勺疼痛的原因包括神经系统疾病、颅外疾病、全身性疾病以及局部皮肤感染等，具体如下。
一、神经系统疾病：
1.神经系统的感染，例如细菌性脑膜炎，这是由细菌感染引起的脑膜炎症，会导致剧烈头痛；结核性脑膜炎，因结核杆菌侵袭脑膜所致，头痛常较为严重；病毒性脑炎，病毒侵害脑部引发，可出现明显头痛症状。
2.颅内占位性病变，像神经系统的肿瘤，会压迫周围组织引起头痛；头颅的外伤导致颅内出血，血液积聚可引发头痛；脑血管畸形，容易造成脑部血流异常而致头痛；颅内高压，会使颅内压力升高进而导致头痛。
二、颅外疾病：
1.儿童常见的鼻窦炎，炎症刺激可引起枕部或头顶部疼痛。
2.颈部肌肉损伤、炎症、脓肿或者是结核、肿瘤等，也可能导致头痛。
三、全身性疾病：
1.全身性的感染性疾病，如肺炎、败血症、流感等，在发热时通常会伴有显著的头痛。
2.慢性的缺氧或毒物中毒，也可能出现头痛。
四、局部皮肤感染：如果宝宝经常用手抓挠头皮，致使头皮部位破损，又未及时进行消毒处理，一旦受到细菌、真菌的感染，引发毛囊炎疾病，就会有局部皮肤红肿、疼痛等表现。
总之，小孩后脑勺疼痛可能由多种原因引起，需要仔细分析和诊断，以便采取针对性的治疗措施。