右肾囊肿手术后不舒服可能由多种原因引起，以下是一些可能的情况：
1.手术部位疼痛：手术后切口处可能会有疼痛，但通常会随着时间逐渐减轻。如果疼痛持续加重或伴有发热、红肿等症状，可能是感染的迹象，需要及时就医。
2.腰部不适：手术后腰部可能会感到不适或胀痛，这可能是正常的术后反应。但如果不适感明显或伴有血尿、蛋白尿等异常，应及时告知医生。
3.其他症状：少数情况下，可能会出现恶心、呕吐、腹胀等消化系统症状，或发热、寒战等全身症状。这些症状可能与手术相关，也可能是其他潜在问题的表现。
如果出现手术后不舒服的情况，建议采取以下措施：
1.休息：给身体足够的时间恢复，避免过度劳累。
2.观察症状：密切观察不舒服的程度和持续时间，以及是否出现其他新的症状。
3.联系医生：及时告知医生你的症状，遵循医生的建议进行进一步的检查或治疗。
4.遵循医嘱：按照医生的要求进行用药和护理，如服用止痛药、按时换药等。
需要注意的是，每个人的身体恢复情况不同，手术后的不适反应也可能有所差异。如果对手术后的身体状况有任何疑虑或担忧，应及时与医生沟通，以便获得个性化的建议和指导。医生会根据具体情况进行评估，并制定相应的处理方案。