甲状腺瘤的引起原因目前尚不十分明确，可能与多种因素相关。一般认为，遗传因素可能起到一定作用，比如有家族甲状腺瘤病史的人群，相对来说患病风险可能会有所增加。另外，碘的摄入异常也可能与之有关，长期碘摄入不足或过量都可能影响甲状腺的正常功能，从而增加甲状腺瘤发生的几率。还有，放射性物质的接触也是一个可能因素，比如儿童时期头颈部接受过放射性照射，长大后患甲状腺瘤的风险会有所升高。
遗传因素影响
家族遗传倾向： 研究发现，如果家族中有亲属患有甲状腺瘤，那么家族其他成员患甲状腺瘤的可能性比一般人群要高一些。不过具体的遗传方式还在进一步研究中，但这种家族聚集现象提示遗传在甲状腺瘤发病中起到一定作用。基因层面关联： 目前已经发现一些与甲状腺瘤相关的基因变异，但不是说携带这些基因变异就一定会发病，只是增加了发病的风险。
碘摄入因素
碘摄入不足： 当人体长期处于碘摄入不足的状态时，甲状腺会通过代偿性增生来试图合成更多的甲状腺激素，长期这样的代偿过程就可能增加甲状腺瘤发生的几率。比如一些远离海洋且长期食用碘盐补充不足的地区，甲状腺瘤的发病率可能会相对高一些。碘摄入过量： 相反，长期碘摄入过量也可能影响甲状腺的正常功能，导致甲状腺组织异常增生，进而引发甲状腺瘤。像一些沿海地区居民，如果长期大量食用含碘丰富的食物，又不注意控制，也可能增加患甲状腺瘤的风险。
放射性物质接触
儿童期放射性暴露： 儿童时期如果头颈部接受过放射性照射，比如因某些疾病进行过放射性治疗等，那么在成年后患甲状腺瘤的风险会明显高于没有放射性暴露史的人群。有研究表明，儿童期头颈部受到100毫西弗以上放射性照射，甲状腺瘤的发病风险会显著增加。职业性放射性接触： 一些职业中需要长期接触放射性物质的人群，如放射科医生等，如果防护不当，也会面临较高的甲状腺瘤发病风险。