早上老拉肚子可能由多种原因引起。比如，肠易激综合征就比较常见，这类人群早上拉肚子的概率较高，大约有10% - 20%的人会受其困扰。
肠道菌群失调
肠道菌群失衡： 正常情况下肠道菌群保持平衡，但如果因为饮食不规律、长期使用抗生素等原因，就可能导致肠道菌群失调。比如长期大量使用广谱抗生素后，有害菌可能大量繁殖，有益菌减少，就会影响肠道的正常功能，出现早上拉肚子的情况。饮食因素影响： 如果前一天吃了过多生冷、辛辣刺激的食物，也可能打乱肠道菌群环境，引发早上拉肚子。例如大量食用冰镇饮料、辣椒等，会刺激肠道蠕动加快，导致早上排便异常。
腹部受凉
夜间保暖不当： 夜间睡眠时如果腹部没有盖好被子，受到冷空气刺激，肠道容易痉挛，从而导致早上拉肚子。尤其是季节更替时，气温变化较大，如果没有及时增添衣物，腹部受凉的几率会增加。空调使用不当： 夏天使用空调时，如果温度调得过低，腹部直接对着空调出风口，也容易使腹部受凉，引发早上拉肚子。比如室内空调温度设置在20℃以下，且整晚对着腹部吹，就很可能出现这种情况。
消化系统疾病
慢性肠炎： 患有慢性肠炎的人，肠道黏膜处于炎症状态，早上起来后肠道蠕动会相对活跃，再加上炎症的刺激，就容易出现拉肚子的现象。这类患者可能还会伴有腹痛、腹胀等症状，病程较长，有的可能持续数月甚至数年。甲状腺功能亢进： 甲状腺功能亢进患者，由于甲状腺激素分泌过多，会加快机体的新陈代谢，包括肠道的蠕动速度也会加快，从而导致早上频繁拉肚子。这类患者通常还会有心慌、手抖、消瘦等其他甲亢相关症状。