清宫两周后小腹还有针扎似的疼痛，可能是以下原因引起：
1.术后恢复欠佳：清宫术会对子宫和子宫内膜造成一定的创伤，术后需要一定的时间来恢复。如果术后休息不好、过度劳累、剧烈运动等，可能会影响子宫的恢复，导致小腹疼痛。
2.感染：清宫术是一种有创操作，如果手术过程中消毒不严格、术后不注意个人卫生等，可能会引起感染，导致盆腔炎、子宫内膜炎等疾病，出现小腹疼痛、发热、分泌物异常等症状。
3.宫腔残留：清宫术可能无法将宫腔内的组织完全清除干净，如果有残留的组织，可能会刺激子宫收缩，导致小腹疼痛。
4.子宫收缩：清宫术后，子宫会自然收缩，以排出宫腔内的积血和组织。收缩时可能会引起小腹疼痛，这种疼痛通常是阵发性的，且逐渐减轻。
5.其他：子宫肌瘤、子宫内膜异位症、宫颈炎等疾病也可能导致清宫后小腹疼痛。
如果清宫两周后小腹仍有针扎似的疼痛，建议及时就医，进行相关检查，如B超、血常规等，以明确原因，并在医生的指导下进行治疗。同时，术后要注意休息，避免劳累和剧烈运动，保持个人卫生，避免感染。如果疼痛严重或伴有其他不适症状，应及时就医。