六岁宝宝肚子疼的原因包括：
一、胃肠功能紊乱：宝宝腹部受凉、饮食不规律、进食过多过杂过于油腻过冷等可致胃肠功能紊乱，引发肚子疼，多为上腹或脐周阵发性疼痛。对此可通过口服益生菌和调节胃肠功能的中成药，以及进行腹部按摩等对症处理，能逐渐缓解。
二、肠系膜淋巴结炎：主要表现为右下腹和脐周疼痛，常发生在上呼吸道感染、肠道感染等情况后。可针对原发疾病治疗，并辅助改善胃肠功能，疼痛会逐渐减轻。
三、腹型过敏性紫癜：能引起孩子肚子疼，多数疼痛剧烈，还有皮肤瘀点、瘀斑甚至便血等表现。需针对过敏性紫癜治疗，同时给予禁食禁水、糖皮质激素治疗。
四、外科急腹症：如肠套叠、肠梗阻、阑尾炎等，宝宝疼痛通常较剧烈，需及时就医，完善相关检查并及时处理，以防病情加重延误治疗。
五、急性胃肠炎：多伴有呕吐、腹泻、发热、腹痛等症状，经胃肠炎及时治疗后症状可缓解。
六、肠道寄生虫病：宝宝可出现腹痛、食欲减退、消瘦等情况，通过大便寄生虫或虫卵镜检可明确诊断，需给予驱虫治疗。
七、胃部疾病：如胃炎、胃溃疡等，宝宝可有上腹部或剑突下疼痛，且有明显规律性。需完善胃镜检查、幽门螺旋杆菌检测等相关检查以明确诊断，然后给予药物治疗。总之，六岁宝宝肚子疼的原因多样，必要时需完善血常规、电解质、C反应蛋白、腹部立位平片、腹部彩超等相关检查以进一步明确原因并及时治疗。