一般来说，新生儿进行心脏彩超检查是安全的，不会对其造成危害。但在某些罕见情况下，可能会出现以下不良反应：
1.短暂的呼吸急促：在进行心脏彩超检查时，新生儿可能需要短暂地停止呼吸，这可能会导致一些新生儿出现呼吸急促的情况。这种情况通常是短暂的，会在检查后自行缓解。
2.低血糖：在进行心脏彩超检查前，如果新生儿没有进食，可能会出现低血糖的情况。这种情况通常是轻微的，可以通过喂食来缓解。
3.情绪激动：在进行心脏彩超检查时，新生儿可能会感到不安或紧张，这可能会导致他们情绪激动。这种情况通常是短暂的，会在检查后自行缓解。
4.感染：在进行心脏彩超检查时，需要将探头放在新生儿的胸部，这可能会导致感染的风险。但是，这种情况非常罕见，医生会在检查前对探头进行消毒，以降低感染的风险。
需要注意的是，以上不良反应都是罕见的，且通常是轻微的，可以通过适当的处理来缓解。如果您对新生儿的心脏彩超检查有任何疑问或担忧，请与医生进行沟通。