儿童阴茎肿痛的原因包括受到外伤、包皮过长以及包皮龟头炎等，应及时就医并根据具体情况进行处理。具体如下：
一、受到外伤：若儿童在玩耍时不慎撞到阴茎，就可能引发阴茎肿痛。这种情况下应避免让儿童触碰患处，让其多休息。要是情况较为严重，需尽快就医。
二、包皮过长：
1.儿童存在包皮过长或包茎时，可能导致阴茎肿痛。因为这会使得儿童排尿不顺畅以及污垢堆积，进而继发感染。
2.平时要特别注意儿童的卫生状况，保持阴茎清洁。必要时可到医院选择手术治疗。
三、包皮龟头炎：
1.儿童患上包皮龟头炎也会造成阴茎肿痛，通常与卫生不佳有关。
2.可在医生指导下加强温水冲洗，也可外用莫匹罗星乳膏、红霉素软膏等药物进行治疗。平时要督促孩子养成良好卫生习惯，勤洗澡、勤换衣，不让孩子用手抓挠患处以免发生感染。饮食上应注重清淡，多喝水，多吃新鲜水果蔬菜。如果上述处理效果不理想，要及时前往医院就诊。
总之，当发现儿童阴茎肿痛时，要尽快明确原因，并在医生指导下采取恰当的处理措施，同时要注重儿童的日常护理，以促进其恢复。