骨折微创手术具有以下缺点：
一、难以达到解剖复位。骨折微创手术不能在直视下进行复位操作，这就导致其很难使骨折端实现解剖复位。尤其在发生开放粉碎性骨折的情况下，骨折移位比较显著，不仅难以达成解剖复位，甚至连功能复位都可能存在困难。此时骨折的对位对线不佳，会对正常愈合产生影响，容易引发延迟愈合、不愈合或者畸形愈合等状况。
二、易出现并发症。虽然骨折微创手术创伤较小，对血供的破坏也较少，恢复速度相对较快。但是部分骨折块，特别是粉碎性骨折块可能无法完全复位，从而导致骨折游离。若骨质间隙较宽较大，愈合时间会明显延长，甚至可能因骨折部位感染而诱发慢性骨髓炎。骨折端还会出现骨痂明显生长的现象，致使骨折部位显著肿大，并伴有局部结节形成。
三、手术费用高。骨折微创手术需要用到各种大型设备，如C型臂、X线透视机、骨科专用器械等，成本较高，因此手术费用也会相应地增加。
总结概况提示：骨折微创手术存在难以达到解剖复位、易引发并发症以及手术费用较高等缺点，在实际应用中需要综合考虑这些因素。