肾结石排出来了依然腰疼，原因可能包括泌尿系统存在梗阻、结石未完全排净或是肾损伤等。
一、结石梗阻：在肾结石排出时，即便最小的结石也可能在尿道中形成堵塞，引发结石梗阻情况，进而表现为腰痛。比如结石在输尿管狭窄处卡住，导致尿液无法顺畅排出，引起腰部疼痛不适。
二、结石未排干净：有可能部分结石尚未彻底排出，残留的结石在肾组织内活动，所以依然会有腰疼症状。这些残留的小结石可能会继续刺激肾脏组织，导致疼痛持续存在。
三、肾损伤：肾结石在排出过程中可能会刮伤肾脏黏膜，即便结石已排出，但受损的肾组织尚未愈合，因此会出现腰疼现象。就如同皮肤被划伤后，在伤口未痊愈时会有疼痛一样。
此外，也可能是腰肌劳损所导致。如果腰疼症状较为严重，务必及时就医进行详细检查和诊断，以便明确具体原因并采取针对性的治疗措施。
总之，肾结石排出后腰疼的原因多样，需要仔细甄别，及时处理。