早晨起来嘴里有臭气，可能由生理性因素、口腔疾病、胃肠道疾病等导致，需依据具体病因进行对症治疗。
一、生理性因素：若晚上不刷牙，食物残渣会长时间卡在牙缝中，经口腔细菌发酵，就容易出现早晨起来嘴里有臭气的情况。可通过认真刷牙以及使用漱口水漱口等方式来改善。
二、口腔疾病：
1.牙龈炎、牙周炎：通常还伴有牙龈红肿、疼痛以及对外界刺激敏感等症状。
2.口腔溃疡：也可能引起嘴里臭气。
3.龋病：这也是常见原因之一。口腔疾病是导致早晨嘴里臭气的主要原因之一，需要前往正规医院根据具体病因采取相应治疗，如树脂充填、根管治疗、牙周洁治等。
三、胃肠道疾病：如果存在经常胃肠反酸等胃肠道疾病，同样会引发早晨起来嘴里有臭气。平时除了要避免食用油腻食物外，还可以服用胃蛋白酶、多酶片等药物进行调节。
总之，早晨起来嘴里有臭气时，需尽快到正规医院进行检查和诊治。