自然流产后月经量少的原因包括贫血、内分泌紊乱、子宫内膜损伤等，具体如下：
一、贫血
1.女性自然流产时流血量多，会使体内循环血量减少，容易引发贫血，进而导致月经量变少。
二、内分泌紊乱
1.如果女性因黄体功能不全、多囊卵巢综合症、甲状腺功能低下等内分泌疾病而自然流产，在原发病未治愈时，仍存在内分泌失调现象，会引起月经紊乱，表现为月经量少、月经周期缩短或延长等。
三、子宫内膜损伤
1.若自然流产后宫腔内有残留妊娠组织，通过清宫手术清理，若医生操作不当损伤子宫内膜，会引发宫腔粘连，致使女性月经量少。
总结概况提示：自然流产后月经量少可能是由贫血、内分泌紊乱、子宫内膜损伤等多种因素导致，需根据具体情况进行分析和诊断，以便采取相应的治疗措施。