目前治疗甲状腺炎并没有绝对最好的单一方法，需根据不同类型采取相应措施。比如亚急性甲状腺炎，通常可采用非甾体抗炎药缓解疼痛和发热，约有半数患者在数周内可自行缓解。
亚急性甲状腺炎的治疗
药物缓解疼痛： 非甾体抗炎药如阿司匹林，能减轻炎症引起的疼痛和发热症状。一般来说，成人可根据病情适量服用，但需注意观察胃肠道反应。激素治疗情况： 如果病情较重，非甾体抗炎药效果不佳时，可考虑使用糖皮质激素，如泼尼松，能快速缓解症状，但使用时要遵循医生的剂量调整方案。
自身免疫性甲状腺炎的治疗
观察随访为主： 慢性淋巴细胞性甲状腺炎（桥本病）早期如果甲状腺功能正常，一般只需定期随访，每6-12个月检查甲状腺功能和甲状腺超声。甲状腺功能异常时处理： 当出现甲状腺功能减退时，需补充左甲状腺素钠片，维持甲状腺功能正常，且需要长期服用，并根据甲状腺功能指标调整剂量。
产后甲状腺炎的治疗
短暂甲状腺功能异常处理： 产后甲状腺炎出现甲亢期时多为短暂性，一般不需要抗甲状腺药物治疗，注意休息，多数可自行恢复；如果出现甲减期且甲状腺功能减退症状明显，可短时间补充左甲状腺素钠片，多数患者产后6-12个月甲状腺功能可恢复正常。
感染性甲状腺炎的治疗
抗感染治疗： 细菌感染引起的甲状腺炎需要使用抗生素，如头孢类抗生素，根据感染的严重程度选择口服或静脉给药。局部处理： 如果有甲状腺脓肿形成，可能需要进行穿刺引流或手术切开引流，以促进感染控制。