父亲是乙肝病毒携带者生孩子不会遗传，因为其不属于遗传性疾病，但有可能会传染给孩子。
一、男性乙肝病毒携带者体内有乙型肝炎病毒，可能通过以下途径传染给孩子：
1.通过性接触传播给性伴侣，若伴侣被传染且怀孕后，可经母婴途径传给孩子，婴儿娩出时会接触母亲含有乙肝病毒的血液、体液而被感染。
2.在少数情况下，男性乙肝病毒携带者的精子可能携带乙肝病毒从而导致孩子感染。
二、为降低感染风险，乙肝病毒携带者的伴侣应采取以下措施：
1.接种乙肝疫苗以及乙肝免疫球蛋白，提高体内乙肝抗体滴度。
2.伴侣怀孕后要定期入院进行乙肝五项检查及其他各项孕期检查。
三、如果孕期检查出体内存在乙肝病毒感染，应进行以下处理：
(1)怀孕期间需进行抗病毒治疗来阻断传播。
(2)孩子娩出后，要在24小时内接种乙肝免疫球蛋白和乙肝疫苗。
总之，对于乙肝病毒携带者的家庭，要充分了解传染途径和预防措施，通过科学的方法来减少孩子感染乙肝的风险。