霉菌性阴炎主要是由白色念珠菌感染引起的，约10%~20%的非孕女性及30%的孕妇阴道中有此菌寄生，但菌量少不引起症状，当全身及阴道局部免疫能力下降，尤其是局部细胞免疫力下降，白色念珠菌大量繁殖就会引发炎症。
自身菌群失调导致
阴道内环境变化： 正常情况下，阴道内有多种微生物平衡共存。当长期应用广谱抗生素时，会抑制乳酸杆菌生长，破坏了阴道的微生态平衡，白色念珠菌就会大量繁殖引发炎症。比如连续使用广谱抗生素超过1周，就可能增加患霉菌性阴炎的风险。免疫力下降： 当人体免疫力低下时，比如患有糖尿病，血糖控制不佳，阴道内糖原含量增高，酸度增加，有利于念珠菌的生长繁殖。据统计，约60%的糖尿病患者容易反复发生霉菌性阴炎。另外，长期应用免疫抑制剂、接受化疗或放疗的患者，也容易出现霉菌性阴炎。
局部卫生不良引发
内裤不恰当穿着： 穿着紧身化纤内裤，会使阴道局部温度及湿度升高，适合念珠菌生长。比如连续2天穿着紧身化纤内裤，就可能改变阴道局部环境，增加感染几率。过度清洁阴道： 有些女性习惯用洗液频繁冲洗阴道，这样会破坏阴道的酸性环境和正常菌群，导致阴道自净能力下降，容易诱发霉菌性阴炎。一般建议每周用清水清洗阴道1~2次即可，过度清洗反而不好。
接触感染途径导致
公共设施传播： 使用公共浴池、浴盆、马桶等，若被白色念珠菌污染，健康人接触后可能被感染。比如在公共浴室使用了未消毒的毛巾或坐了被污染的马桶圈，就有感染风险。性接触传播： 霉菌性阴炎可以通过性接触传播，女方患病后，约10%的男方会受到感染，出现阴茎头炎等。所以在治疗期间应避免无保护的性行为。