男性HPV感染可以通过以下检查来明确情况：首先，醋酸白试验是比较常用的一种检查方法，大约3%-5%的醋酸溶液涂抹在疑似病变部位，如果局部变白，就可能提示HPV感染，但它的特异性不是100%。
细胞学检查
TCT检查： 也就是薄层液基细胞学检查，通过采集宫颈或其他部位的细胞，观察细胞形态是否有异常，来初步判断是否有HPV感染相关的细胞变化。一般建议有性生活的男性定期进行TCT筛查，有助于早期发现病变。阴道镜检查： 如果细胞学检查发现异常，可能需要做阴道镜检查。医生会用阴道镜放大观察宫颈、阴茎等部位的上皮病变情况，必要时可以在可疑部位取组织进行活检，进一步明确是否存在HPV感染导致的病变。
核酸检测
PCR检测： 聚合酶链反应检测是检测HPV核酸的常用方法，它可以精准检测出是否感染了特定型别的HPV。这种检测方法灵敏度较高，能够早期发现HPV感染，对于男性HPV感染的诊断有重要意义，比如可以检测出肛门、阴茎等部位是否存在HPV病毒核酸。杂交捕获技术： 也是检测HPV DNA的一种方法，能检测多种高危型和低危型HPV，通过定量检测HPV DNA的载量等情况，辅助判断HPV感染的状况，帮助医生评估病情的严重程度等。
组织病理学检查
活检： 当通过前面的检查怀疑有病变时，就需要取病变组织进行病理检查。病理医生会在显微镜下观察组织细胞的形态、结构等变化，明确是否有HPV感染引起的组织学改变，比如是否有异常增生等情况，这对于确诊HPV感染相关的病变以及制定治疗方案非常关键。例如，当阴茎部位有可疑的赘生物时，取组织活检可以明确是否是HPV感染导致的尖锐湿疣等病变。