三个月宝宝胃食管反流病有生理性和病理性之分。具体如下：
一、生理性因素：主要表现为溢乳。这是因为三个月宝宝胃部括约肌发育不成熟，或是胃部神经肌肉协调功能存在障碍，从而导致贲门肌肉松弛，使得胃内食物反流，进而出现溢乳现象。这种情况常发生在日间餐时和餐后，空腹及睡眠时基本不出现，且宝宝生长发育不受影响，症状会随年龄增长而逐渐减轻。
二、病理性因素：
1.哭闹不安：由于反流导致胃酸刺激食管黏膜，引起食管部位疼痛，三个月宝宝就会表现出哭闹不安、烦躁、拒食等症状。
2.咳嗽、喘息：三个月宝宝胃食管反流时，胃酸反流刺激气管，造成气管黏膜损伤，致使气管平滑肌痉挛，从而出现咳嗽、喘息现象，所以会有反复咳喘的情况。
3.窒息：三个月宝宝胃食管反流时，胃内容物反流引发咽喉痉挛或呼吸道梗阻，导致宝宝脸色青紫或苍白、呼吸困难，进而出现窒息现象。
总之，三个月宝宝胃食管反流病要注意区分生理性和病理性，对于病理性的胃食管反流病要及时关注和治疗，避免不良后果。