脑损伤后遗症常见的有颅骨缺损、外伤性癫痫、脑外伤后综合征等，不同后遗症需遵医嘱给予相应治疗，如手术治疗、药物治疗、心理治疗等。
一、颅骨缺损
颅骨缺损通常采用施行颅骨修补术的治疗方法，若缺损＞3厘米则应进行修补。手术目的在于保护脑组织、缓解临床症状以及恢复美观。修补材料可分为自体材料和异体材料。
二、外伤性癫痫
外伤性癫痫主要依靠抗癫痫药物治疗，常用药物包括卡马西平、丙戊酸钠等。癫痫完全控制两年后，患者一般可在医生指导下逐步减药。对于药物治疗无效且检查发现存在局部致癫痫灶的晚期癫痫，也可遵医嘱进行手术治疗。
三、脑外伤后综合征
脑外伤后综合征主要通过综合性治疗手段处理。要做好患者的思想工作，使其保持乐观心态，同时酌情使用中西药物对症治疗。对于脑外伤引起的创伤后应激障碍，主要依靠心理和药物的综合治疗，常用药物有帕罗西汀、舍曲林等。
四、认知功能障碍
脑损伤后遗症还可能出现认知功能障碍，可通过非药物治疗处理，包括认知行为训练、计算机辅助训练等，目前临床上尚无特效药物，常用金刚烷胺、哌甲酯等药物。
对于出现脑损伤后遗症的患者，应及时前往正规医院相关科室就诊，并在专业医生指导下进行相关治疗。