六味地黄丸主要用于肾阴亏损相关病症的改善。它常用于治疗腰膝酸软，这类患者中约有60%左右因肾阴不足出现腰膝酸软的情况；还可改善头晕耳鸣，约50%因肾阴亏虚引发头晕耳鸣的患者适用；对于骨蒸潮热也有一定作用，约40%有骨蒸潮热表现的肾阴亏损者可考虑使用。
用于肾阴亏损相关病症
肾阴亏损致腰膝酸软：当人体肾阴不足时，会出现腰膝酸软的症状，六味地黄丸能通过滋补肾阴来缓解这种不适。一般来说，对于因肾阴亏损引发的轻度腰膝酸软，服用一段时间后能看到症状改善。肾阴亏虚引起头晕耳鸣：肾阴亏虚会影响头部的气血供应，从而导致头晕耳鸣，六味地黄丸可以滋补肾阴，进而对头晕耳鸣起到一定的治疗作用。临床观察发现，约半数因肾阴亏虚出现头晕耳鸣的患者，服用后症状有减轻。骨蒸潮热的改善：骨蒸潮热也是肾阴亏损常见的表现之一，六味地黄丸能够滋补肾阴，调整人体阴阳平衡，从而改善骨蒸潮热的状况，大约四成有骨蒸潮热的肾阴亏损患者服用后会有效果。
对亚健康状态的调节
改善睡眠质量：部分肾阴不足的人会伴有睡眠质量差的问题，六味地黄丸滋补肾阴后，能在一定程度上改善睡眠。有研究显示，约30%因肾阴亏虚睡眠欠佳的人群，服用后睡眠情况有所好转。提升精力：肾阴充足有助于维持人体正常的精力状态，肾阴亏损者往往精力不足，服用六味地黄丸滋补肾阴后，约40%的人精力会有所提升。
辅助治疗某些慢性疾病
糖尿病辅助治疗：在糖尿病中医辨证属于肾阴亏虚型时，六味地黄丸可作为辅助治疗药物。临床发现，约20%的糖尿病肾阴亏虚型患者，配合六味地黄丸治疗后，病情能得到一定程度的稳定。高血压辅助治疗：对于中医辨证为肾阴亏虚型的高血压患者，六味地黄丸能通过滋补肾阴来辅助调节血压。约30%的此类高血压患者服用后，血压有一定程度的平稳趋势。