胃神经官能症的治疗需综合多方面因素，一般可通过心理调节、药物辅助等方式来改善。通常来说，心理治疗在其中占据重要地位，约有60% - 70%的患者通过合适的心理干预能取得较好效果。
心理治疗方面
认知行为疗法： 通过帮助患者认识到情绪与胃部不适的关联，改变不良的认知和行为模式。比如让患者学习识别自身的负面思维，如过度担忧胃部健康而产生的焦虑想法，然后逐步纠正这些思维，建立积极的应对方式。放松训练： 深呼吸放松是常见的方法，患者每天可进行2 - 3次深呼吸，每次持续5 - 10分钟，通过缓慢吸气、停顿、缓慢呼气的过程，放松身体和精神。渐进性肌肉松弛也是有效手段，从头到脚依次紧张和放松各个肌肉群，让身体达到深度放松状态，每周可进行3 - 4次。
药物辅助治疗
调节胃肠动力药物： 多潘立酮可以促进胃肠蠕动，加快胃排空，缓解腹胀、早饱等症状。莫沙必利同样能增强胃肠动力，改善消化不良的情况，一般建议在饭前15 - 30分钟服用。调节胃酸药物： 若患者伴有胃酸分泌过多导致的反酸、烧心等症状，可使用铝碳酸镁，它能迅速中和胃酸，缓解不适，而且可以在胃黏膜表面形成保护屏障。雷贝拉唑等质子泵抑制剂也能抑制胃酸分泌，适用于胃酸分泌过多较严重的患者，但要注意长期使用可能存在的一些潜在风险，需在医生指导下使用。
生活方式调整
饮食规律： 每天要定时进餐，早餐、午餐、晚餐尽量固定时间，每餐的食量要适中，避免过饱或过饥。一般每餐七八分饱比较合适，尽量减少食用辛辣、油腻、刺激性食物，如辣椒、油炸食品、咖啡、浓茶等，这些食物容易刺激胃肠道，加重神经官能症症状。适度运动： 每周进行3 - 5次有氧运动，每次运动30分钟以上，如快走、慢跑、游泳等。运动可以促进身体的新陈代谢，改善胃肠功能，同时也有助于缓解压力和焦虑情绪。但要注意运动强度要适中，避免过度劳累。比如快走可以选择每小时4 - 6公里的速度，坚持20 - 30分钟。