孩子已经发烧两天了，且反复烧到39℃，此时必须要思考发热的缘由。一方面是感染性发热，这可能是由细菌、病毒、支原体等感染引发的发热；另一方面是非感染性发热，像川崎病、血液系统疾病等都能致使小孩出现发热情况。针对这种状况，我们需要找出导致发热的原因，并依据不同原因制定不同的处理办法：
一、可以让孩子多补充水分，若孩子能够配合，则可施行物理降温举措，例如头部冷敷、温水擦浴以及洗温水澡等；
1.头部冷敷：使用湿冷毛巾敷于孩子头部，通过热量传递降低头部温度。
2.温水擦浴：用温水浸湿毛巾后擦拭孩子身体，利用水分蒸发带走热量。
3.洗温水澡：让孩子在适宜温度的温水中浸泡，帮助散热。
二、要是孩子有显著不适症状，这时可以选择给孩子口服退热药物，当下推荐的退热药物是布洛芬或者对乙酰氨基酚，这两种药物总体来说比较安全，而且对大多数孩子的退热效果也是不错的；
三、建议在给孩子口服退热药物以及进行物理降温的同时，需要尽快到医院就诊，必要时完善血常规等相关检查，以防耽误病情和治疗；
四、倘若孩子的发热持续不消退，或者出现嗜睡、呼吸费力、惊厥等表现，那就需要立刻到医院就诊，避免延误病情。
总之，孩子发烧后要密切关注其状态，根据具体情况采取相应措施，若情况异常或持续不缓解，应及时就医。