结石的形成是多种因素共同作用的结果。比如肾结石，其形成与尿液中某些物质浓度过高有关，像草酸、尿酸、钙等成分，如果尿液中这些物质含量异常增高，就容易析出形成结石。一般来说，尿液中溶质过饱和是结石形成的基本条件。
代谢异常引起结石
尿液成分异常： 当尿液中钙、草酸、尿酸、胱氨酸等物质排出量增加时，就容易形成结石。例如，尿酸排泄过多会增加尿酸结石形成的风险，有研究表明，高尿酸血症患者发生尿酸结石的概率比正常人群高很多。肠道吸收功能紊乱： 像回肠切除术后，会使肠道对草酸盐的吸收增加，进而导致尿液中草酸盐浓度升高，增加草酸钙结石形成的可能性。
局部因素引发结石
尿路感染： 泌尿系统受到细菌等病原体感染时，细菌、脓块等会作为核心，促使结石形成。比如变形杆菌感染时，细菌产生的尿素酶可分解尿液中的尿素，使尿液碱化，促使磷酸镁铵和磷酸钙沉积形成结石。尿路梗阻： 尿路存在狭窄、肿瘤等情况导致尿液排出受阻，尿液中的晶体物质就容易在局部沉积，逐渐形成结石。比如输尿管结石如果引起尿路梗阻，就会加快结石的形成进程。
生活方式导致结石
饮水不足： 每天饮水量少于1500毫升时，尿液会浓缩，尿液中溶质的浓度相对升高，更容易析出形成结石。所以建议每天保证2000 - 3000毫升的饮水量，以稀释尿液，降低结石形成风险。饮食不均衡： 长期高钙、高草酸、高嘌呤饮食易诱发结石。高钙饮食如大量摄入奶制品等，可能会使尿液中钙含量增加；高草酸饮食如过多食用菠菜、巧克力等，会导致尿液中草酸含量升高；高嘌呤饮食如经常吃动物内脏、海鲜等，会使尿酸生成增多，增加尿酸结石形成几率。