双侧附睾炎的治疗需综合多方面因素，一般可通过药物治疗、一般治疗等方式来处理。通常来说，药物治疗是主要手段之一。
药物治疗选择
抗生素应用：如果是细菌感染引起的双侧附睾炎，常用抗生素有头孢菌素类，如头孢克肟等，这类药物通过抑制细菌细胞壁的合成来发挥杀菌作用；还可以选用喹诺酮类药物，像左氧氟沙星，它能阻碍细菌DNA复制从而达到抗菌效果。一般需要根据细菌培养和药敏试验结果来精准选择抗生素，通常需要用药1-2周左右。止痛药物辅助：当患者有明显疼痛症状时，可使用非甾体抗炎药，如布洛芬，它能通过抑制环氧化酶的活性，减少前列腺素合成，从而起到抗炎、止痛的作用。
一般治疗措施
卧床休息与抬高阴囊：患者要注意卧床休息，同时可以用阴囊托或毛巾将阴囊抬高，这样有助于促进血液回流，减轻阴囊的肿胀和疼痛，一般建议卧床休息1-2周左右。避免刺激：患病期间要避免长时间站立或行走，也要避免性生活和体力劳动等，防止加重局部充血水肿。
手术治疗情况
少数情况需手术：如果双侧附睾炎经过药物治疗效果不佳，或者出现了脓肿等情况，可能需要进行手术治疗。比如形成较大脓肿时，需要通过手术切开引流，手术一般在局部麻醉或椎管内麻醉下进行。但手术治疗相对较少见，多数患者通过药物和一般治疗就能得到较好控制。
治疗中的注意事项
定期复查：在治疗过程中，患者需要定期复查，通过血常规、超声等检查来了解病情的恢复情况。一般治疗开始后1-2周要进行首次复查。注意个人卫生：要保持会阴部清洁，每天用温水清洗，勤换内裤，防止细菌滋生加重感染。