过敏性结膜炎和细菌性结膜炎在以下方面存在区别：
一、病因不同。过敏性结膜炎是因对过敏原过敏引发的自身免疫性结膜炎，而细菌性结膜炎则是由细菌感染导致的结膜炎。
二、临床表现各异。首先，过敏性结膜炎主要呈现结膜充血水肿以及黏液性分泌物，患者主要感觉眼红，尤其是眼痒明显。其次，细菌性结膜炎表现为充血水肿更为严重，伴有黄绿色黏稠样且量较大的分泌物，患者会有红、肿、热、痛这些细菌性炎症的典型表现。
三、治疗方法有别。过敏性结膜炎主要通过点用抗过敏滴眼液来治疗，如色甘酸钠滴眼液、普拉洛芬滴眼液或激素类滴眼液等。细菌性结膜炎则主要采用抗细菌滴眼液进行治疗，像左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液等抗细菌滴眼液。
总结提示：明确了过敏性结膜炎和细菌性结膜炎在病因、临床表现和治疗方面的差异，有助于准确诊断和选择合适的治疗方法。