儿童孤独症的治疗需要综合多种方法，通常是一个长期的过程。目前并没有一种单一的特效治疗方法能完全治愈，但通过科学合理的干预可以改善症状。例如，早期干预对于儿童孤独症的预后非常重要，一般建议在儿童2 - 6岁这个关键时期尽早开展干预。
康复训练干预
应用行为分析疗法（ABA）：这是一种常用的康复训练方法，通过对儿童的行为进行分析和干预，帮助他们学习新的技能和行为。比如可以训练儿童的语言表达、社交互动等能力，一般需要专业的治疗师长期进行一对一的指导。结构化教育（TEACCH）：这种方法是根据儿童的特点，为他们提供一个结构化的学习环境。通过安排有组织、有顺序的活动，帮助儿童更好地适应环境和学习。例如在教室布置上采用明确的区域划分，让儿童清楚不同区域的功能，从而逐步培养他们的生活和学习技能。
药物辅助治疗
抗精神病药物：对于有严重情绪问题、自伤或攻击行为的儿童孤独症患者，可能会使用抗精神病药物。比如利培酮，它可以在一定程度上缓解儿童的情绪不稳定等症状，但需要在医生的严格评估下使用，因为这类药物可能会有一些副作用，如体重增加等。抗抑郁药物：如果儿童孤独症患者伴有抑郁症状，可能会用到抗抑郁药物。像舍曲林等，但同样要谨慎使用，必须由医生根据儿童的具体情况来决定是否使用以及使用的剂量等。
家庭支持与参与
家庭训练配合：家长在儿童孤独症的治疗中起着至关重要的作用。家长需要学习相关的康复训练方法，并在家中持续对儿童进行训练。例如家长可以在家中模拟社交场景，引导儿童进行互动交流，每天坚持一定时间的训练，帮助儿童巩固在专业机构学到的技能。营造支持性家庭环境：家庭环境对儿童孤独症的康复也很重要。家长要给予儿童足够的关爱和耐心，营造一个温暖、稳定且有规律的家庭氛围。避免过于严厉或过度保护的家庭模式，让儿童在轻松的氛围中逐渐改善社交等方面的能力。