巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种常见类型，其症状主要有以下这些。约1/3的患者可能没有明显症状，但多数患者会出现痛经，这种痛经往往是进行性加重的，可能在月经来潮前1~2天开始出现，持续整个经期，甚至可能在月经结束后还会持续一段时间。
一、月经相关症状
月经量改变： 部分患者会出现月经量增多的情况，有的女性原本规律的月经量会明显比以前多，可能超过80毫升。还有些患者会出现月经周期紊乱，月经提前或者推迟的情况比较常见。比如原本28天左右的月经周期，可能会变成20天或者35天左右。经期腹痛： 除了进行性加重的痛经外，有些患者在经期还会有下腹坠胀感。这种坠胀感可能会持续整个经期，影响日常生活和工作。而且有的患者不仅经期腹痛，在非经期也可能会有下腹部的隐痛，尤其是在劳累、剧烈运动后可能会加重。
二、盆腔相关症状
盆腔疼痛： 除了下腹部的疼痛外，巧克力囊肿还可能引起盆腔内的慢性疼痛。这种疼痛可能会在性交时加重，大约有30%~40%的患者会出现性交疼痛的情况。在进行妇科检查时，可能会触及盆腔内有触痛的结节。盆腔包块： 有些较大的巧克力囊肿可以在盆腔触及包块。一般包块有一定的活动性，但与周围组织可能有粘连。包块大小不一，小的可能几厘米，大的甚至可以达到10厘米以上。如果囊肿发生破裂，会引起突发的剧烈腹痛，类似于急腹症的表现。
三、对生育的影响
不孕： 巧克力囊肿会影响生育，大约有30%~50%的子宫内膜异位症患者会合并不孕。这是因为囊肿会影响卵巢的排卵功能，还会影响输卵管的正常蠕动，从而影响卵子和精子的结合以及受精卵的运输，导致难以受孕。宫外孕风险增加： 由于盆腔内环境受到巧克力囊肿的影响，输卵管的通畅性可能受到干扰，受精卵可能无法正常到达子宫腔，而在输卵管等部位着床，导致宫外孕的发生风险比正常女性要高。