结石的治疗方法有多种，比如对于较小的肾结石，一般直径小于6毫米的结石，有一定的自行排出概率，患者可以通过大量饮水来帮助结石排出，每天饮水量需达到2000~3000毫升以上，同时要适当运动，像跳绳、跳跃等运动可能有助于结石排出。
药物治疗方面
利尿剂： 像氢氯噻嗪等利尿剂可以增加尿液生成，帮助稀释尿液，减少结石形成的机会，同时可能辅助较小结石的排出，但需在医生指导下使用。碱化尿液药物： 例如枸橼酸氢钾钠，能碱化尿液，降低尿液中某些成分形成结石的可能性，对于尿酸结石等有一定的预防和辅助治疗作用。
手术治疗情况
体外冲击波碎石： 适用于直径在2~2厘米以下的肾结石或输尿管上段结石等。它是利用冲击波聚焦后作用于结石，将结石击碎，使其随尿液排出体外。一般来说，经过1~2次体外冲击波碎石治疗，多数结石可以被击碎排出，但对于一些质地坚硬的结石可能效果不佳。输尿管镜取石术： 适用于中下段输尿管结石以及较大的肾结石等情况。医生通过尿道插入输尿管镜，找到结石后，用套石篮将结石取出，或者用激光等将结石击碎后取出。这种手术创伤相对较小，恢复较快。
微创治疗手段
经皮肾镜取石术： 主要用于治疗较大的肾结石，尤其是那些直径大于2厘米的结石。医生通过腰部建立一个通道，直达肾脏，然后用肾镜找到结石，用激光、气压弹道等将结石击碎并取出。该手术对于较大的结石清除效果较好，但术后需要一定时间恢复。输尿管软镜取石术： 可以治疗一些较为复杂的肾结石，特别是那些位于肾脏上盏、下盏等较为隐蔽位置的结石。输尿管软镜从尿道进入，经过膀胱、输尿管到达肾脏，然后利用激光等将结石击碎取出。这种手术创伤更小，但操作相对复杂，对医生技术要求较高。