事后紧急避孕药常见的副作用包括月经紊乱，一般在服用后的1~2个月内可能出现月经提前或推迟的情况，有的女性月经周期可能会发生改变。比如原本规律的月经，可能会出现提前7天以上或者推迟7天以上的情况。
胃肠道不适方面
恶心呕吐： 约有10%左右的人服用事后紧急避孕药后会出现恶心的症状，少数人还会伴随呕吐。一般发生在服药后的短时间内，比如服药后1~2小时内。食欲不振： 部分人在服药后会感觉胃口变差，不想吃东西，这种情况可能会持续1~2天。
类早孕反应
头晕乏力： 大概有5%~10%的人会出现头晕、浑身没力气的情况，一般比较轻微，不影响正常生活的话，不需要特殊处理，通常1~2天会自行缓解。乳房胀痛： 少数人会出现乳房胀痛的现象，疼痛程度因人而异，有的可能只是轻微胀痛，有的可能感觉比较明显，但一般也会在1~2周内逐渐减轻或消失。
其他可能出现的情况
阴道不规则出血： 服用事后紧急避孕药后，约有5%~10%的人会出现阴道少量出血，一般出血量较少，类似点滴状，持续时间较短，大多在3~7天内干净，但也有个别人出血时间稍长一些。不过如果阴道出血量较多，如同月经量，或者出血时间超过7天，就需要及时就医。情绪变化： 个别人可能会出现情绪波动，比如烦躁、焦虑等，但这种情况相对比较少见。