怀孕三个月流产，其原因包括胚胎因素、母体因素、环境因素、父亲因素以及剧烈运动等。
一、胚胎因素：
1.多数是因为胚胎或胎儿染色体异常。其中染色体异常涵盖数目异常与结构异常。胚胎染色体常见的如13-三体、16-三体等；胎儿染色体异常有平衡易位、倒置以及嵌合体等情况，这些都可能引发流产。
二、母体因素：
1.孕妇若患有严重贫血、心力衰竭、血栓性疾病、严重感染、慢性肝肾疾病，或是存在子宫畸形、宫腔粘连，还有内分泌功能异常等问题，均有可能导致流产。
三、环境因素：
1.孕妇接触像甲醛、苯、氯化乙烯等有毒化学物质时，也可能致使流产。
四、父亲因素：
1.精子染色体异常也有出现流产的可能。
五、剧烈运动：
1.比如在怀孕头三个月过度劳累、过度运动，以及怀孕时有性生活且过度撞击腹部等，都可能造成流产。此外，孕妇过量吸烟、喝酒也可能引发流产。
怀孕三个月出现流产后，务必要查找病因并依据病因进行治疗。同时要注意多休息，避免过度劳累，注意饮食营养，可以多食用一些富含蛋白质和维生素的食物。
总结提示：怀孕三个月流产的原因多样，涉及胚胎、母体、环境、父亲及剧烈运动等方面，明确原因并进行针对性处理和调养很重要。