HPV11属于低危型人乳头瘤病毒，感染后部分患者可自行清除病毒，一般无需特殊治疗，但如果出现相关病变则需相应处理。
病毒清除情况
大部分免疫力正常的人感染HPV11后，在1-2年内约有60% - 90%可通过自身免疫系统清除病毒。所以感染HPV11后先不要过于紧张，定期复查很重要。
出现相关病变的处理方式
生殖器疣的处理
如果感染HPV11后长出生殖器疣，可采用物理治疗，比如冷冻治疗，利用低温使疣体组织坏死脱落；还可以用激光治疗，通过激光的热能破坏疣体。另外，也可使用药物治疗，如外用鬼臼毒素酊等，但药物治疗需在医生指导下使用，且用药时要注意保护周围正常皮肤。
密切观察随访
对于没有明显病变的HPV11阳性者，要定期进行妇科检查（女性）或男科检查（男性），一般建议每6 - 12个月进行一次HPV和宫颈（或生殖器）细胞学检查，观察有无病变进展情况。如果在随访过程中发现有病变倾向，要及时采取相应措施。
生活注意事项
感染HPV11后要注意保持良好的生活习惯，增强自身免疫力很关键。要保证充足的睡眠，每天尽量保证7 - 8小时的睡眠时间；还要均衡饮食，多摄入富含维生素、蛋白质的食物，如新鲜蔬菜、水果、瘦肉、鱼类等；同时要避免熬夜、吸烟、酗酒等不良生活行为，因为这些不利于免疫力的维持。另外，在性生活中要使用安全套，防止病毒传播给他人。