长效避孕药停药后不来月经，其原因包括怀孕、避孕药副作用、疾病因素等。
一、怀孕方面。如果在月经未来临的这段时间有性生活且未采取避孕措施，可在同房后7到10天去医院抽血化验HCG以确定是否怀孕。因为即便已停用长效避孕药，但只要有未避孕的性行为，就存在怀孕的可能，而怀孕后月经通常会停止。
二、避孕药副作用方面。长效避孕药属于激素类药物，长期服用会对体内激素水平产生较大影响，进而容易导致月经周期紊乱。所以建议在停用长效避孕药时，最好再继续服用两三个月的短效避孕药来进行过渡。要是月经一直不来，可以前往医院化验性激素六项，然后依据化验结果适当补充雌孕激素。
三、疾病因素方面。像甲状腺功能减退或者贫血等疾病也会引发月经不来的情况。对此，可以去医院化验甲功、血常规等。如果发现存在异常，就需要及时补充甲状腺素或进行补血治疗，一旦这些疾病得到解决，月经通常就会恢复正常。
总之，长效避孕药不适合长期服用，如果有妊娠计划，建议停药半年后再进行正常备孕。