小孩打完13价肺炎疫苗后发烧到41度是一种常见的不良反应，需要采取以下措施：
1.服用退烧药：可以按照医生的建议给小孩服用退烧药，如布洛芬或对乙酰氨基酚等。注意按照药品说明书的剂量和使用方法服用，不要超量服用。
2.物理降温：可以用温水擦拭小孩的额头、颈部、腋窝、腹股沟等部位，帮助降低体温。但要注意避免过度擦拭，以免引起小孩不适。
3.多喝水：发烧会导致小孩体内水分流失，要及时给小孩补充水分，可以让小孩多喝水或饮用适量的果汁、盐水等。
4.观察小孩的情况：密切观察小孩的体温、精神状态、呼吸等情况，如果小孩出现高热不退、精神萎靡、呼吸急促等异常情况，应及时就医。
5.就医：如果小孩发烧持续时间较长或体温较高，或出现其他异常症状，应及时就医。医生会根据小孩的具体情况进行诊断和治疗，并给予相应的建议和指导。
需要注意的是，每个小孩的体质和反应都不同，如果对小孩的病情有任何疑问或担忧，应及时咨询医生的意见。同时，在小孩接种疫苗后，要注意观察小孩的身体状况，如有异常应及时就医。