脸上扁平疣可通过药物治疗、物理治疗、联合治疗等方式来彻底去除。具体如下：
一、药物治疗：如果扁平疣症状较轻，可在医生指导下用药，如咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶软膏、维A酸乳膏等。这些药物可以抑制病毒复制，同时促进疣体脱落。比如咪喹莫特乳膏，它能通过诱导机体产生抗病毒蛋白，发挥抗病毒作用；氟尿嘧啶软膏可干扰DNA的合成，从而抑制扁平疣病毒；维A酸乳膏则可调节表皮细胞的增殖和分化，有助于疣体的消退。
二、物理治疗：常采用微波治疗、液氮冷冻、激光治疗等。利用冷冻和热原理使疣体逐渐坏死、脱落。微波治疗通过微波的热效应破坏疣体组织；液氮冷冻利用低温使疣体组织坏死；激光治疗则是利用高能量激光精确地去除疣体。
三、联合治疗：对于较大的扁平疣，可采取手术切除治疗，术后还需遵医嘱给予抗病毒药物，如恩替卡韦片、拉米夫定片等。手术能直接去除疣体，而抗病毒药物可以防止病毒残留和复发。
总之，可根据扁平疣的具体情况选择合适的治疗方法来将其彻底去除。