上额窦炎的药物治疗需根据病情来选择，一般常用抗生素、鼻用糖皮质激素等药物。通常来说，抗生素使用可能需要持续一定时间来控制感染。
抗生素类药物
青霉素类抗生素：如果患者对青霉素不过敏，可考虑使用青霉素类药物，它能抑制细菌细胞壁的合成，从而发挥抗菌作用。但要注意用药前需进行青霉素皮试。头孢菌素类抗生素：这类药物也是常用的，例如头孢呋辛等，通过干扰细菌细胞壁合成来杀菌，对多种细菌有较好的抗菌活性，可用于上额窦炎的治疗，但使用前也需询问患者过敏史等情况。
鼻用糖皮质激素
糠酸莫米松鼻喷雾剂：它能减轻鼻腔炎症反应，缓解鼻塞、流涕等症状。一般成人及12岁以上儿童可以使用，使用时要注意正确的喷鼻方法，避免药物进入口腔等。布地奈德鼻喷雾剂：同样属于鼻用糖皮质激素，可减轻上额窦炎引起的鼻腔黏膜炎症，缩小肿胀的鼻甲，改善鼻窦的引流等，但儿童使用时需在医生指导下谨慎应用，要考虑儿童的年龄和病情程度等因素。
黏液促排剂
桉柠蒎肠溶软胶囊：它可以调节黏液纤毛清除功能，促进鼻窦及鼻腔内的黏液排出，有助于改善上额窦的通气和引流情况，成人一般可以服用，儿童服用时要根据年龄和体重等调整剂量，在医生指导下使用。欧龙马口服滴剂：也有促进分泌物排出的作用，能使上额窦内的炎性分泌物更好地排出，从而缓解上额窦炎相关症状，儿童用药时要严格按照儿童的年龄阶段来确定合适的用量。
减充血剂
盐酸羟甲唑啉滴鼻液：能收缩鼻腔黏膜血管，减轻鼻腔充血、肿胀，缓解鼻塞症状，但这类药物不宜长期使用，一般连续使用不宜超过7天，否则可能引起药物性鼻炎等不良反应，成人和儿童使用时剂量和疗程都有不同要求，儿童需在医生监护下使用。